經(jīng)國務(wù)院批準(zhǔn)，2015年8月10日，財政部、海關(guān)總署和國家稅務(wù)總局印發(fā)了《關(guān)于對化肥恢復(fù)征收增值稅政策的通知》（財稅〔2015〕90號），規(guī)定自2015年9月1日起，對納稅人銷售和進(jìn)口的化肥，統(tǒng)一按13%稅率征收增值稅，原有的增值稅免稅和先征后返政策相應(yīng)停止執(zhí)行。

　　自1994年以來，國家對國內(nèi)生產(chǎn)流通和進(jìn)口的部分化肥品種一直實行免征或者先征后返增值稅等優(yōu)惠政策，在保障化肥供應(yīng)、穩(wěn)定農(nóng)資價格、支持農(nóng)業(yè)生產(chǎn)等方面發(fā)揮了積極作用。但隨著形勢的發(fā)展變化，上述政策的弊端日益顯現(xiàn)。一方面，化肥增值稅優(yōu)惠政策是在我國化肥供不應(yīng)求、國家對其實行價格管制、增值稅抵扣鏈條不完整的背景下出臺的，當(dāng)前市場和政策環(huán)境都發(fā)生了較大變化，化肥價格管制已經(jīng)全面放開，供求關(guān)系已經(jīng)由供不應(yīng)求轉(zhuǎn)為產(chǎn)能過剩，且隨著營業(yè)稅改征增值稅改革試點的推進(jìn)，化肥企業(yè)的進(jìn)項稅抵扣越來越充分，繼續(xù)對化肥實行增值稅優(yōu)惠政策的必要性不大。另一方面，從政策執(zhí)行情況看，農(nóng)民和企業(yè)實際受益不大，還帶來了重復(fù)征稅和政策不統(tǒng)一等問題，特別是化肥產(chǎn)能過剩和過度施用問題日益突出，要求取消化肥增值稅優(yōu)惠政策的呼聲越來越強(qiáng)烈，部分化肥生產(chǎn)企業(yè)也建議盡快恢復(fù)征稅。為了落實中央農(nóng)村工作會議關(guān)于把過量使用的農(nóng)業(yè)投入品盡快減下來的要求，順應(yīng)形勢的發(fā)展變化，解決政策執(zhí)行中出現(xiàn)的問題，有必要適時停止執(zhí)行化肥增值稅優(yōu)惠政策。

　　當(dāng)前，化肥價格處于相對低位，市場供應(yīng)充足、競爭充分，為化肥增值稅優(yōu)惠政策的調(diào)整提供了有利契機(jī)。同時，國家對有機(jī)肥仍然在生產(chǎn)流通全環(huán)節(jié)實行免征增值稅政策，有利于鼓勵有機(jī)肥的生產(chǎn)和使用，優(yōu)化用肥結(jié)構(gòu)，促進(jìn)農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展。此外，由于國家設(shè)有農(nóng)資綜合補(bǔ)貼并動態(tài)調(diào)整等制度安排，即使化肥價格出現(xiàn)一些波動，調(diào)整化肥增值稅優(yōu)惠政策對正常的農(nóng)業(yè)生產(chǎn)和農(nóng)民增收不會產(chǎn)生大的影響。